Pierwsze jednotomowe wydanie Encyklopedii Krakowa ukazało się w 2000 r. nakładem Wydawnictwa Naukowego PWN. W 2016 r. Biblioteka Krakowa podjęła inicjatywę przygotowania nowej, rozbudowanej i uaktualnionej wersji wydawnictwa. W 2019 r. odkupiono od PWN prawa do haseł składających się na pierwszą edycję.
Nowe hasła napisało blisko 300 osób, które wraz z autorami pierwszej edycji tworzą imponujący zespół ponad 1000 osób. Publikacja została sfinansowana ze środków miasta Krakowa. Partnerem edycji jest Archiwum Narodowe w Krakowie.
Encyklopedia Krakowa jest dostępna w regularnej sprzedaży w sklepie Muzeum Krakowa w pałacu Krzysztofory na Rynku Głównym 35. Jest czynny od wtorku do niedzieli w godzinach 10.30–18.00. Można ją też kupić w sklepie internetowym: sklep.muzeumkrakowa.pl.
Okazją do zapoznania się z publikacją była prezentacja podczas 26. Międzynarodowych Targów Książki w Krakowie. Podczas spotkania będzie można było porozmawiać z współtwórcami Encyklopedii Krakowa, w tym z jej redaktorem naczelnym prof. Jackiem Purchlą oraz dyrektorem Biblioteki Kraków Agnieszką Staniszewską-Mól. Podczas targów Encyklopedię Krakowa i inne publikacje Muzeum Krakowa można kupić na stoisku B70 w hali Dunaj.